Сюжет начинается с начала 2 сезона! Наруто возвращается в Коноху, где его ждут его друзья, которые за его время тренировок тоже не теряли время зря. В мире пока все тихо, еще никто не подозревает о нависшей угрозе организации "Акацуки". В их планах создать мир, полный добра, без войн, крови, и боев! Создать мир гармонии. Но для этого, им нужны хвостатые, за которыми они уже выслали несколько нукенинов. Лидеров деревни Скрытой в листве является - Цунаде, она пока разбирается с бумажками и выдает миссии, все тихо и спокойно, также изредка тренируясь с Харуно Сакурой. В Суне молодой Казекаге Гаара, пытается получить доверие своего народа и старается доказать всем, что он больше не является угрозой для своей деревни, а наоборот, ее защитой. Темари и Канкуро пытаются ему помочь воплотить его мечту в реальность. А на престоле Мизукаге у нас Ягура. И да, на нем нет гендзюцу Тоби. Это и есть наша поправка, которую мы ввели. Продолжая вести жесткую политику, он тем самым вызвал большой негатив со стороны Теруми Мей, которая создала небольшую группу людей, повстанцев, которые хотят свергнуть нынешнего Мизукаге с престола и прекратить эту невыгодную для народа политику и воссоздать мир на земле Киригакуре но Сато. Для этого она хочет в тайне от своего лидера создать союз с Конохой, чтобы Скрытый Лист помог им свергнуть правителя, что же ответит Лист? Ивагакуре под правлением старика Оноки, крепко стоит на ногах, в планах правителя, завоевать маленькие деревни, такие как : Куса, Таки и Аме. Но прекрасно понимая, что выступать одной деревне против троих не выгодно, и Ива ищет себе союзника, но пока не известно, кто станет им. О Кумогакуре ничего не слышно и не видно, но Райкаге заинтересован Орочимару, так как тот, создал не мало бед за последние 3 года. Прошли слухи, что Молния собираются объявить войну Туману за убийство их группы шиноби на территориях страны Звука, но Киригакуре все отрицает, дабы разобраться во всем, Райкаге и Мизукаге договариваются о встрече, в стране Железа. Отогакуре со своим правителем Орочимару тихо и мирно стоит в сторонке и наблюдает за тем, как Кумо и Кири пожирают друг друга. Ведь это именно дело рук белого змея. Для чего спросите вы? Все довольно просто, в стране Звука все чаще стали появляться шиноби страны Молнии, каждый раз не один шиноби не возвращался, почуяв угрозу и обнаружение своих опытов и экспериментов, Орочимару пытается сбить след, тем самым отведя Райкаге от себя. Акацуки тем временем начинают свои действия, первым в их списке является однохвостый Гаара. Дейдара в паре с Сасори выдвигаются в ближайшее время!